Iako može delovati kao sigurno okruženje, auto-put nosi određene opasnosti. Visoke brzine vozila, često iznad 100 km/h, čine automobile, a posebno autobuse i kamione, potencijalnim “projektilima” koji mogu izazvati ozbiljne nesreće. U Srbiji, u poslednje tri godine na auto-putevima je život izgubilo 150 ljudi.
Jedna od zakonom propisanih mera za bezbednost na auto-putu je korišćenje migavca ili pokazivača pravca prilikom svake promene smera. Nažalost, vozači u Srbiji često zanemaruju ovu praksu, stavljajući sve učesnike u saobraćaju u opasnost.
Korišćenje migavca treba sprovesti tokom svakog prestrojavanja, posebno prilikom izlaska iz zaustavne trake, kako bi se značajno smanjila opasnost od sudara. Održavanje sigurnog rastojanja je takođe ključno, primenjujući pravilo “dve sekunde” za optimalnu bezbednost, a u slučaju kiše ili magle, ovo rastojanje treba povećati.
Vožnja auto-putem može biti zamorna, stoga se preporučuju kraće pauze svaka dva-tri sata vožnje, uključujući izlazak iz vozila, konzumiranje osvežavajućih pića i izbegavanje teške hrane.
Dodatni saveti za bezbednost na auto-putu uključuju izbegavanje vožnje ako ste umorni, vezivanje svih putnika, posebno dece u odgovarajućim dečjim sedištima, održavanje koncentracije tokom vožnje, nevršenje popravki na licu mesta u slučaju kvara, već pozivanje šlep službe, i obavezno korišćenje svetloodbojnog prsluka prilikom izlaska iz vozila na zaustavnoj traci.